Kubo est un être aussi intelligent que généreux, qui gagne chichement sa vie en sa qualité de conteur, dans un village de bord de mer. Cette petite vie tranquille, ainsi que celle de ses compagnons Hosato, Hashi et Kamekichi va être bouleversée quand par erreur il invoque un démon du passé. Surgissant des nues cet esprit malfaisant va abattre son courroux sur le village afin d'appliquer une vindicte ancestrale.
"La méthode reste artisanale, l'équipe de 400 personnes est venue à bout de 250 000 feuilles de papier, 40 000 paires de gants en latex et 111 000 aimants. Le tout pour un résultat magnifique, car le film immerge le spectateur dans des délices graphiques nipponnes, à coups d'idéogrammes, de dragons, ou de kimonos. Bluffant." (Renaud Baronian, le Parisien), "Les marionnettes de Kubo font preuve de plus d'émotion que nombre de personnages incarnés par des acteurs de chair et d'os. (...) Ce n'est pas le moindre des prodiges de Laika que de donner, en sus de la vie, une âme aux marionnettes." (Noémie Luciani, Le Monde), "Un tour de force technologique autant que récit initiatique d'une justesse troublante." (Christophe Foltzer, Ecran Large), "Le film mêle tout ce qu'il faut d'humour et de souffle épique pour emporter petits et grands sur des images d'une beauté renversante, dans un Japon ancien qu'on croirait peuplé des créatures de Tim Burton." (Sophie Benamon, L'Express), "Au creux de cette trépidante aventure, qui réjouira tous les publics, se déploie aussi une belle et riche parabole sur la filiation et la résilience, sur la nécessité de se libérer du passé pour bien grandir." (Cécile Mury, Télérama).