La mort apparente de Kaito, touché par balle, déclenche un phénomène de “flood” : Nagai produit soudain une énorme quantité de matière noire. Sato saute sur l'occasion et se synchronise à lui pour en produire encore davantage… La base d'Iruma est désormais couverte d'innombrables fantômes noirs. Alors qu'une véritable tornade de matière noire sème le chaos à l'intérieur de la base, le professeur Ogura, le plus grand spécialiste de la question, se rapproche des lieux. L'occasion d'en savoir plus sur ce que sont vraiment les “ajin”…